FHIR MCP Server — インストール & ライブデモ

なぜ使うのか

主な機能

All FHIR R4/R5 resource types: Patient, Observation, MedicationRequest, etc.
Search by parameter (date range, code, identifier)
Reference traversal — follow Patient → Observation → Encounter chains
Bulk export for cohort queries
Works against any FHIR server (Epic, Cerner sandbox, HAPI, Aidbox)

ライブデモ

実際の動作

fhir-mcp-server.replay ▶ 準備完了

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インストール

クライアントを選択

~/Library/Application Support/Claude/claude_desktop_config.json · Windows: %APPDATA%\Claude\claude_desktop_config.json

{
  "mcpServers": {
    "fhir-mcp-server": {
      "command": "uvx",
      "args": [
        "fhir-mcp-server"
      ]
    }
  }
}

Claude Desktop → Settings → Developer → Edit Config を開く。保存後、アプリを再起動。

~/.cursor/mcp.json · .cursor/mcp.json

{
  "mcpServers": {
    "fhir-mcp-server": {
      "command": "uvx",
      "args": [
        "fhir-mcp-server"
      ]
    }
  }
}

Cursor は Claude Desktop と同じ mcpServers スキーマを使用。プロジェクト設定はグローバルより優先。

VS Code → Cline → MCP Servers → Edit

{
  "mcpServers": {
    "fhir-mcp-server": {
      "command": "uvx",
      "args": [
        "fhir-mcp-server"
      ]
    }
  }
}

Cline サイドバーの MCP Servers アイコンをクリックし、"Edit Configuration" を選択。

~/.codeium/windsurf/mcp_config.json

{
  "mcpServers": {
    "fhir-mcp-server": {
      "command": "uvx",
      "args": [
        "fhir-mcp-server"
      ]
    }
  }
}

Claude Desktop と同じ形式。Windsurf を再起動して反映。

~/.continue/config.json

{
  "mcpServers": [
    {
      "name": "fhir-mcp-server",
      "command": "uvx",
      "args": [
        "fhir-mcp-server"
      ]
    }
  ]
}

Continue はマップではなくサーバーオブジェクトの配列を使用。

~/.config/zed/settings.json

{
  "context_servers": {
    "fhir-mcp-server": {
      "command": {
        "path": "uvx",
        "args": [
          "fhir-mcp-server"
        ]
      }
    }
  }
}

context_servers に追加。保存時に Zed がホットリロード。

claude mcp add fhir-mcp-server -- uvx fhir-mcp-server

ワンライナー。claude mcp list で確認、claude mcp remove で削除。

ユースケース

実用的な使い方： FHIR MCP Server

Build a chronological clinical timeline for one patient

👤 Clinical informatics, research teams ⏱ ~15 min intermediate

使うタイミング： You need a summary of one patient's encounters, meds, and labs across visits.

前提条件

Server/skill installed and authenticated — See repo README

フロー

Get the patient

Find Patient with identifier MRN-12345 and return name, DOB, and active conditions.✓ コピーしました

→ One Patient + Condition list
Build the timeline

Retrieve all Encounters and MedicationRequests for that patient in the last 12 months. Sort chronologically and summarize.✓ コピーしました

→ Time-sorted list with encounter type + meds prescribed

結果： A clinician-readable summary you can paste into a chart note.

注意点

Real PHI — Real PHI — never connect this to a chat that's also pasting screenshots to a third-party service. Use a HIPAA-compliant Claude deployment.

組み合わせ： filesystem · memory

組み合わせ

他のMCPと組み合わせて10倍の力を

fhir-mcp-server + filesystem

Pair with filesystem for complementary capabilities

Use this server together with filesystem to complete a multi-step task.✓ コピーしました

fhir-mcp-server + memory

Pair with memory for complementary capabilities

Use this server together with memory to complete a multi-step task.✓ コピーしました

ツール

このMCPが提供する機能

ツール	入力	呼び出すタイミング	コスト
fhir_search	resource_type, params	Find resources matching criteria	1 API call
fhir_read	resource_type, id	Read one specific resource	1 API call
fhir_create	resource_type, body	Write a new clinical resource	1 API call

コストと制限

運用コスト

APIクォータ: See provider docs for rate limits
呼び出しあたりのトークン: Varies by tool
金額: See repo README for pricing details
ヒント: Cache tool results and avoid repeated identical calls.

セキュリティ

権限、シークレット、影響範囲

認証情報の保管： Use environment variables; never commit secrets

データ送信先： Tool calls go to the provider's API as documented

トラブルシューティング

よくあるエラーと対処法

401 from FHIR server

Most FHIR servers use SMART-on-FHIR. Generate a token via your EHR's auth flow and set FHIR_TOKEN.

確認： fhir_search Patient?_count=1 returns a Bundle

Unsupported resource type

Different servers implement different subsets. Check the CapabilityStatement: GET /metadata.

確認： Confirm the resource type is in CapabilityStatement.rest.resource

代替案

FHIR MCP Server 他との比較

代替案	代わりに使う場面	トレードオフ
wso2/fhir-mcp-server	You're on the WSO2 stack	Tighter WSO2 integration

その他

リソース

📖 GitHub の公式 README を読む

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